Como criar atalhos no launcher do Unity

Primeiro, crie um arquivo .desktop para o programa (neste caso o Eclipse).

vim ~/.local/share/applications/eclipse.desktop

Copie e cole o conteúdo do arquivo:

[Desktop Entry]
Type=Application
Name=Eclipse
Comment=Eclipse IDE
Icon=/usr/local/eclipse/icon.xpm
Exec=/usr/local/bin/eclipse
Terminal=false
Categories=Java;

Depois disso, arraste o arquivo eclipse.desktop para o launcher do Unity.
Pronto! Está feito! Vi aqui.